約千点を展示。（うち国指定重要文化財１７７点）収蔵点数約１０万点

殿林遺跡（甲州市　旧塩山市）、一の沢遺跡（笛吹市）出土の縄文土器（いずれも重要文化財）、甲府城跡（甲府市）出土の金箔瓦など。

芸術的にも優れた縄文土器の展示コーナーは見どころの一つです。また当館は「甲斐風土記の丘・曽根丘陵公園」内にあり、整備された４０ヘクタールの公園や、その中に点在する古墳などは自由に見学、散策することができます。公園内の遺跡から出土したものは博物館で見学できます。